MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 plasmid pKPN4

Total Repeats: 2224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009650	TGT	2	6	92	97	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973608
2	NC_009650	GGC	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973608
3	NC_009650	AGA	2	6	356	361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009650	CATG	2	8	430	437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009650	T	6	6	635	640	0 %	100 %	0 %	0 %	152973609
6	NC_009650	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973609
7	NC_009650	TTC	2	6	659	664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973609
8	NC_009650	TCA	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
9	NC_009650	CAG	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973609
10	NC_009650	CGT	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973609
11	NC_009650	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
12	NC_009650	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973609
13	NC_009650	CAT	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973609
14	NC_009650	TTC	2	6	986	991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973609
15	NC_009650	CTGA	2	8	1040	1047	25 %	25 %	25 %	25 %	152973609
16	NC_009650	CT	3	6	1117	1122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009650	T	6	6	1122	1127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009650	T	8	8	1185	1192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009650	TGA	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009650	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009650	TGAA	2	8	1246	1253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009650	AATA	2	8	1254	1261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009650	AGC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009650	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009650	TAA	2	6	1372	1377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009650	A	8	8	1441	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009650	AAG	2	6	1452	1457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009650	TG	3	6	1462	1467	0 %	50 %	50 %	0 %	152973610
29	NC_009650	TGG	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
30	NC_009650	TGG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
31	NC_009650	TGG	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
32	NC_009650	CAA	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973610
33	NC_009650	TTC	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973610
34	NC_009650	ATC	2	6	1803	1808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
35	NC_009650	TAA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
36	NC_009650	TAC	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
37	NC_009650	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
38	NC_009650	CAG	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
39	NC_009650	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
40	NC_009650	CTG	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
41	NC_009650	CTG	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
42	NC_009650	GCT	2	6	2005	2010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
43	NC_009650	TAA	2	6	2043	2048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
44	NC_009650	CTG	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
45	NC_009650	GAA	2	6	2115	2120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973610
46	NC_009650	A	6	6	2170	2175	100 %	0 %	0 %	0 %	152973610
47	NC_009650	GCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
48	NC_009650	ATA	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973610
49	NC_009650	ATG	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973610
50	NC_009650	TGC	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
51	NC_009650	TGC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
52	NC_009650	GCC	2	6	2488	2493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
53	NC_009650	GCT	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
54	NC_009650	AGG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
55	NC_009650	AGC	3	9	2523	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
56	NC_009650	CGC	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973610
57	NC_009650	A	8	8	2546	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	152973610
58	NC_009650	GCA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
59	NC_009650	GAG	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
60	NC_009650	AAAAGC	2	12	2607	2618	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	152973610
61	NC_009650	TGC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973610
62	NC_009650	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973610
63	NC_009650	TGG	2	6	2822	2827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973610
64	NC_009650	GAT	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973610
65	NC_009650	AGC	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973610
66	NC_009650	ATGA	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	152973610
67	NC_009650	ATT	2	6	3331	3336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973610
68	NC_009650	G	8	8	3450	3457	0 %	0 %	100 %	0 %	152973610
69	NC_009650	TTCC	2	8	3482	3489	0 %	50 %	0 %	50 %	152973610
70	NC_009650	TTC	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973610
71	NC_009650	AAGC	2	8	3582	3589	50 %	0 %	25 %	25 %	152973610
72	NC_009650	AGG	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152973610
73	NC_009650	AAAAT	2	10	3780	3789	80 %	20 %	0 %	0 %	152973610
74	NC_009650	TAA	2	6	3796	3801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152973611
75	NC_009650	GAA	3	9	3818	3826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973611
76	NC_009650	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
77	NC_009650	GAT	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973611
78	NC_009650	TATT	2	8	3892	3899	25 %	75 %	0 %	0 %	152973611
79	NC_009650	CTG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
80	NC_009650	TTC	2	6	3967	3972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973611
81	NC_009650	GCT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973611
82	NC_009650	TGA	2	6	4064	4069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973611
83	NC_009650	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009650	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009650	T	6	6	4122	4127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009650	ATG	2	6	4148	4153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009650	CGT	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009650	A	7	7	4329	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	152973612
89	NC_009650	TGT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973612
90	NC_009650	TG	3	6	4387	4392	0 %	50 %	50 %	0 %	152973612
91	NC_009650	GCC	2	6	4413	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973612
92	NC_009650	GGAA	2	8	4442	4449	50 %	0 %	50 %	0 %	152973612
93	NC_009650	GCA	2	6	4487	4492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973612
94	NC_009650	GCG	2	6	4559	4564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973612
95	NC_009650	CTGGA	2	10	4587	4596	20 %	20 %	40 %	20 %	152973612
96	NC_009650	GCAA	2	8	4609	4616	50 %	0 %	25 %	25 %	152973612
97	NC_009650	GGC	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973612
98	NC_009650	TCT	2	6	4643	4648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152973612
99	NC_009650	TCA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973612
100	NC_009650	CGC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973612
101	NC_009650	GAT	2	6	4803	4808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973612
102	NC_009650	GCA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973612
103	NC_009650	TTA	2	6	4880	4885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973612
104	NC_009650	CTC	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009650	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009650	TATCT	2	10	4964	4973	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009650	CTA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009650	CT	3	6	5031	5036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009650	AAGT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009650	GTA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009650	TCC	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_009650	CAG	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973613
113	NC_009650	TGC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973613
114	NC_009650	AAG	2	6	5331	5336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973613
115	NC_009650	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973613
116	NC_009650	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973613
117	NC_009650	CTC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	152973613
118	NC_009650	TTG	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009650	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009650	TGA	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009650	TCT	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009650	GGAA	2	8	5631	5638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009650	CGC	2	6	5830	5835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973614
124	NC_009650	GTCA	2	8	6107	6114	25 %	25 %	25 %	25 %	152973614
125	NC_009650	TCA	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973614
126	NC_009650	CCGA	2	8	6204	6211	25 %	0 %	25 %	50 %	152973614
127	NC_009650	TGG	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973614
128	NC_009650	CG	3	6	6272	6277	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
129	NC_009650	CGG	2	6	6438	6443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973614
130	NC_009650	CG	3	6	6475	6480	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
131	NC_009650	AAG	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973614
132	NC_009650	TGC	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973614
133	NC_009650	CG	3	6	6586	6591	0 %	0 %	50 %	50 %	152973614
134	NC_009650	AAC	2	6	6594	6599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973614
135	NC_009650	TTCC	2	8	6632	6639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009650	A	6	6	6642	6647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009650	CCGG	2	8	6649	6656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009650	CTA	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009650	TAT	2	6	6696	6701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009650	TAA	2	6	6935	6940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009650	GCCC	2	8	6997	7004	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_009650	AG	4	8	7043	7050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009650	GCCA	2	8	7140	7147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_009650	GCT	2	6	12560	12565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973622
273	NC_009650	GCC	2	6	12588	12593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973622
274	NC_009650	GCC	2	6	12609	12614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973622
275	NC_009650	CGG	2	6	12661	12666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973622
276	NC_009650	GCA	2	6	12695	12700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973622
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387	NC_009650	AAT	2	6	18812	18817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_009650	CAAA	2	8	18853	18860	75 %	0 %	0 %	25 %	152973628
389	NC_009650	TCG	2	6	18974	18979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973628
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392	NC_009650	TGG	2	6	19144	19149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973628
393	NC_009650	GAA	3	9	19150	19158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973628
394	NC_009650	GCGA	2	8	19314	19321	25 %	0 %	50 %	25 %	152973628
395	NC_009650	ACC	2	6	19366	19371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152973628
396	NC_009650	GCC	2	6	19481	19486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
397	NC_009650	CAT	2	6	19506	19511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973629
398	NC_009650	GGC	2	6	19627	19632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973629
399	NC_009650	CA	3	6	19640	19645	50 %	0 %	0 %	50 %	152973629
400	NC_009650	TGA	2	6	19683	19688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973629
401	NC_009650	AAC	2	6	19689	19694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152973629
402	NC_009650	GCG	2	6	19695	19700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973629
403	NC_009650	GA	3	6	19742	19747	50 %	0 %	50 %	0 %	152973629
404	NC_009650	TTG	2	6	19778	19783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973629
405	NC_009650	ACG	2	6	19787	19792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152973629
406	NC_009650	CAT	2	6	19794	19799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973629
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408	NC_009650	GCG	2	6	19954	19959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152973629
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411	NC_009650	AAG	2	6	20210	20215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973629
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413	NC_009650	GAA	2	6	20245	20250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152973629
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416	NC_009650	A	7	7	20361	20367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_009650	TGC	3	9	20371	20379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_009650	TGA	2	6	20429	20434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
419	NC_009650	CAT	2	6	20456	20461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
420	NC_009650	CGT	2	6	20511	20516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_009650	GT	3	6	20515	20520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009650	GA	3	6	20633	20638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_009650	ACAA	2	8	20647	20654	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
424	NC_009650	TGT	2	6	20684	20689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
425	NC_009650	GCA	2	6	20699	20704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_009650	GTC	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_009650	TCT	2	6	20864	20869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
428	NC_009650	AGCGGC	2	12	20976	20987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_009650	GTC	2	6	21022	21027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_009650	TGGGC	2	10	21043	21052	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
431	NC_009650	A	7	7	21055	21061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_009650	GTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
433	NC_009650	AGGAA	2	10	21095	21104	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
434	NC_009650	CGG	2	6	21119	21124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_009650	CG	3	6	21245	21250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
436	NC_009650	TAT	2	6	21327	21332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_009650	ATA	2	6	21345	21350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_009650	AT	3	6	21371	21376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_009650	CGGTT	2	10	21407	21416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
440	NC_009650	GAC	2	6	21421	21426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_009650	TGG	2	6	21458	21463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152973630
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445	NC_009650	TCA	2	6	21636	21641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152973630
446	NC_009650	ATA	2	6	21729	21734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_009650	AAT	2	6	21859	21864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_009650	TAT	2	6	22114	22119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152973631
452	NC_009650	CGC	2	6	22152	22157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973631
453	NC_009650	TGC	2	6	22247	22252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152973631
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468	NC_009650	GATT	2	8	22775	22782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
469	NC_009650	TTTAA	2	10	22795	22804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_009650	TTG	2	6	22890	22895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	152973632
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497	NC_009650	GC	3	6	24174	24179	0 %	0 %	50 %	50 %	152973633
498	NC_009650	TTACCT	2	12	24319	24330	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	152973633
499	NC_009650	GCC	2	6	24433	24438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152973633
500	NC_009650	TGA	2	6	24485	24490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152973633

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